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“超级生命计算机”——全球日生产能力最强基因测序仪在深发布

  2018年10月25日,全球最具影响力的集基因组学研究和产业应用于一体的国际交流峰会——第十三届国际基因组学大会(International Conference on Genomics,以下简称“ICG-13”)在深圳举行。

  开幕式上,“超级生命计算机” ——MGISEQ-T7的发布引人注目,这台由华大集团旗下子公司——华大智造自主研发的最新超高通量的基因测序仪一天就可以完成60例个人全基因组测序,日产出数据高达6Tb,是目前全球日生产能力最强的基因测序仪。

  基因是生命的密码,国家级人群基因组学研究以及对遗传资源的保护与应用是精准医学的基础,直接影响到一个国家在生物医药领域的核心竞争力。因此,自国际人类基因组计划之后,各国纷纷推出国家级大规模人群基因组测序项目。

  近日,华大在国际权威学术杂志《细胞》上发布了最大规模中国人基因组学大数据研究成果,这标志着我国已迈出“百万人群基因大数据研究”的重要一步。几乎同一时间,英国政府再次宣布将在未来五年内开展500万人基因组计划。

  然而,由于受到设备数量、速度和成本等现实原因的制约,基因组的测序效率在前几年推进并不顺利。以英国为例,2012年12月,英国启动十万人基因组计划,一直到2018年7月,花了5年半的时间才完成7万多例全基因组测序。

  据了解,本次发布的全新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”,将彻底改变目前现状。日产出数据高达6Tb,意味着一天就可以完成60例个人全基因组测序。以前,十万人级别的基因组测序可能需要4到6年的时间才能完成,现在,仅需6台该测序仪,一年时间即可完成,这将对目前测序产业的发展起到强有力的推动作用,也标志着基于基因检测的精准医学研究全面进入大数据时代成为可能。

  目前,市场上所有的测序仪最多只能支持两张芯片同时运行,而T7的4联芯片平台采用独特的芯片搭载技术,可实现4张芯片进行完全独立的测序流程,如同4台测序仪同时进行工作,且芯片间互不影响。

  同时,MGISEQ-T7可同时支持全基因组测序、超深度外显子测序、表观基因组测序、肿瘤大Panel基因检测。也就是说,用户可以按照他们的不同需求随时随地进行同时测序,并可以最大程度节省时间。

  测序仪运行速度的快慢将直接影响到测序项目的交付时间,因此,业界始终致力于提升测序仪的运行速度。研发团队通过全面升级生化系统、光学系统,并将图像数据处理速度提升15倍,从而使得MGISEQ-T7测序速度提升到行业最高水平的50%以上,远远领先于其他测序仪,仅需不到24小时便可完成PE150。

  据了解,测序仪芯片密度越高,意味着可产出更多的有效数据量。MGISEQ-T7将原有的芯片密度提高了20%,使得单张芯片即可实现Tb级数据产出。加之4张芯片可同时独立运行,24小时无休轮转,MGISEQ-T7每天最多可产出6Tb数据,真正实现强大日生产能力。

  此外,针对基因测序特殊的要求,华大智造研发出自动化样本制备系统MGISP-960,单次最多可自动完成96个样本的制备,支撑了MGISEQ-T7测序通量需求,让MGISEQ-T7的强大性能得以更充分的体现。

  与此同时,华大智造还将在ICG-13的同期卫星会上发布最新建库技术stLFR和生信分析加速产品MegaBOLT。例如肿瘤数据的分析较常规数据更为耗时,而使用MegaBOLT,可以带来15倍以上计算速度的提升,从源头上大幅促进肿瘤研究的进程。同时,MegaBOLT也将上线BGI Online云计算平台,为接下来的基因数据的分析提供了更加灵活高效的解决方案。

  初秋时节,在位于甘肃河西走廊中部、祁连山脚下的山丹马场,开始泛黄的草场与成群的骏马、湛蓝的湖泊共同构成一幅壮美画卷。新华社记者 马宁 摄9月10日无人机在山丹马场拍摄的祁连山下的马群。

  9月10日,2019世界计算机大会在湖南长沙开幕。本次大会以“计算万物湘约未来”为主题,邀请行业专家共聚一堂,共同探讨计算技术产业发展之路。

  送别“黑猫警长之父”戴铁郎:亦线日,著名美术片艺术家、动画片《黑猫警长》导演戴铁郎追悼仪式在上海举行。黑猫警长与白猫班长分列遗像两侧,白鸽探长与“一只耳”在追悼厅外为“戴爷爷”站起“最后一班岗”。戴铁郎于9月4日因病去世,享年89岁。

  9月10日,选手在比赛中。当日,第十一届全国少数民族传统体育运动会民族式摔跤项目比赛在河南省郑州市举行。

  9月9日,在瑞士日内瓦万国宫,香港各界妇女联合协进会主席何超琼(右二)和顾问伍淑清(右一)在“新中国人权事业发展70年”主题边会后接受记者采访。当地时间10日,香港各界妇女联合协进会主席何超琼和顾问伍淑清将在联合国人权理事会第42次会议上发言,介绍香港的有关情况。

  中秋临近,河北省永清县永清镇的“桂香园”加紧赶制手工月饼,为当地百姓献上中秋传统美食。据了解,“桂香园”制作传统手工月饼已有20余年,月饼皮薄松脆,风味独特,深受当地群众青睐。

  近日,第四届澳门国际花灯节在澳门举行,五彩缤纷、琳琅满目的彩灯艺术装置扮靓街头。新华社记者 张金加 摄9月9日在第四届澳门国际花灯节现场拍摄的灯笼。

  9月9日,随着桥面全面开始铺设沥青,桥宽达48米的武汉青山长江大桥主体工程基本完工,标志着这座“最宽长江大桥”进入后续沥青铺设、亮化施工阶段。全长7548米的青山长江大桥,主跨达938米,是武汉市的第11座长江大桥。桥面比武汉沌口长江大桥还宽两米,成为目前跨越长江桥面最宽的桥梁。大桥为双向10车道高速公路,设计时速为100公里。

  2019年7月31日,在安徽省和县乌江镇卜陈村“留守未成年人之家”,92岁的退休教师叶连平在教室里欣赏学生送给自己的折纸礼物。暑假期间,叶连平老师免费为留守在村里的孩子们补习英语。

  强台风“法茜”9日凌晨在日本千叶县登陆。截至当地时间9日8时(北京时间7时),“法茜”已造成千叶县至少10人受伤,多处建筑被毁,千叶县、神奈川县约92万户居民停电。受台风影响,9日清晨日本首都圈内的电车、地铁纷纷停运,市民生活受到很大影响。

  9月9日,四川成都,漂亮的主题列车吸引乘客拍照。当日,随着一声鸣笛的响起,四川黄龙景区“瑶池仙境号”主题地铁列车正式上线始发,该列车将黄龙自然美景融进车厢,让人身临其境。

  9月9日,由中国残疾人事业新闻宣传促进会主办的“共享芬芳、共铸小康”中西部地区百县百场走进青海公益巡演在青海大剧院开演。演出现场,中国残疾人艺术团的特殊演员们表演了舞蹈、舞剧、器乐联奏等10余个精彩节目,灿烂的笑容、优美的舞姿,展现了他们对艺术和生命的热爱。

  四川省凉山州冕宁县彝海镇彝海村坐落在红军长征途中“彝海结盟”地的彝海之滨,曾经受各种条件制约,生活并不富裕。近年来,当地以增加村民就业、提高村民收入为目标,借助红色旅游资源,推动旅游产业扶贫,引入合作企业建设“彝海结盟”红色文化景区,并吸纳村民进入景区工作,目前全村110多户贫困户已经全部脱贫。

  这是9月9日拍摄的“数羊头”仪式现场。新华社记者 觉果 摄9月9日,牧民将羊群赶下山坡。新华社发(孙非摄)9月9日,羊群在进入场地时牧民撒青稞祈福。李鑫 摄9月9日,牧民在赞颂头羊。

  这张拼版照片是2012年至2019年拍摄的250名山区教师的肖像,他们是广西天等县、大新县、全州县、灌阳县、都安瑶族自治县、大化瑶族自治县、龙胜各族自治县、三江侗族自治县、融水苗族自治县、富川瑶族自治县、金秀瑶族自治县部分山区教学点的老师。

  近日,第四届澳门国际花灯节在澳门举行,五彩缤纷、琳琅满目的彩灯艺术装置扮靓街头。新华社记者 张金加 摄9月9日在第四届澳门国际花灯节现场拍摄的灯笼。

  9月13日,中国将迎来传统佳节——中秋节。月饼作为中秋节的传统糕点,久负盛名,备受人们喜爱。那么世界上的其他地区是否也有自己独特的传统糕点,让人食之难忘呢?答案是肯定的。

  9月9日,来自全球33个国家和地区的43位出席“2019丝路环球旅游小姐世界总决赛”的参赛选手在宁夏中卫采风拍摄,体验当地特色风情,感受中国文化。

  近日,2019年台北盆景展在台北士林园艺所举行。罗汉松、赤松、线盆造型各异的盆景吸引了众多观赏者。新华社记者 陈斌 摄9月9日,一名参观者在台北士林园艺所观赏盆景。